全院現(xiàn)有在職職工1672人，設(shè)有內(nèi)、外、婦、兒等52個(gè)臨床科室，藥劑科、檢驗(yàn)科、放射科、超聲診斷科等12個(gè)醫(yī)技科室，以及省心血管病研究所、省老年病研究所、省胃腸研究所、省急診醫(yī)學(xué)研究所、省核醫(yī)學(xué)研究所等5個(gè)研究所。2005年，醫(yī)院對(duì)優(yōu)勢(shì)項(xiàng)目進(jìn)行重新整合，建立福建省心臟介入調(diào)節(jié)中心、福建省消化內(nèi)鏡中心、福建省微創(chuàng)外科調(diào)節(jié)中心等3個(gè)省級(jí)醫(yī)學(xué)中心。