醫(yī)院專業(yè)齊全，各具特色，擁有全軍中心2個(gè)：骨科、燒傷整形科;原南京軍區(qū)專科中心7個(gè)：消化內(nèi)科、呼吸結(jié)核科、普通外科、神經(jīng)外科、心胸外科、檢驗(yàn)病理科、衛(wèi)勤訓(xùn)練中心;醫(yī)學(xué)影像科為廈門(mén)大學(xué)醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)影像研究所。擁有住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)基地12個(gè)，ISO15189國(guó)際認(rèn)可醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室1個(gè)，是全軍團(tuán)級(jí)醫(yī)院一家“國(guó)內(nèi)臨床藥師培訓(xùn)基地”醫(yī)院，先后建立了消化內(nèi)科、骨科2個(gè)“福建省院士專家工作站”，現(xiàn)有樊代明、邱貴興2個(gè)院士專家團(tuán)隊(duì)進(jìn)站工作。