新疆軍區(qū)總醫(yī)院前身為國(guó)民黨聯(lián)勤總部第60醫(yī)院，新疆和平解放后，1950年1月整編建院。歷經(jīng)10多次編制調(diào)整，1986年定編為蘭州軍區(qū)烏魯木齊總醫(yī)院。2016年隸屬陸軍建制，改稱新疆軍區(qū)總醫(yī)院。