醫(yī)院在1948年11月，東北解放后，元帥、諾爾曼·白求恩1939年締造的晉察冀軍區(qū)衛(wèi)生學校遷至長春，長春大學醫(yī)學院附屬醫(yī)院更名長春醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院，1950年更名為長春軍醫(yī)大學第二學院，1954年更名為解放軍第一軍醫(yī)大學第二醫(yī)院，1978年更名為白求恩醫(yī)科大學第二臨床學院， 2000年6月白求恩醫(yī)科大學與吉林大學等五校合并為新的吉林大學后，醫(yī)院更名為吉林大學第二醫(yī)院。