醫(yī)院設有33個臨床專業(yè)學科和醫(yī)技學科，針灸科、臨床心理?？?、高壓氧科、職業(yè)病科、重癥科、心理科、干診科、中醫(yī)科、皮膚科、口腔科、眼科、耳鼻咽喉科、小兒內(nèi)科、婦產(chǎn)科、麻醉科、泌尿外科、心胸外科、神經(jīng)外科、骨外科、血管外科、普外腫瘤科、急診科、消化內(nèi)科、腎內(nèi)科、神經(jīng)內(nèi)科、內(nèi)分泌科、呼吸內(nèi)科、心血管內(nèi)科，其中有心血管、內(nèi)科、心臟外科、周圍血管外科、呼吸內(nèi)科、神經(jīng)內(nèi)科、干診科六個市級重點學科。心血管內(nèi)科是沈陽市Ⅰ級重點學科，是目前沈陽市規(guī)模較大的心血管?？?，心血管病學、呼吸系統(tǒng)疾病學是沈陽醫(yī)學院重點學科。