截至2014年12月，碩士生導師158名，博士生導師88名，設(shè)有3個博士后流動站，19個博士點、28個碩士點。醫(yī)院現(xiàn)有1個組織工程工程研究中心，1個教育部數(shù)字醫(yī)學工程研究中心，上海市組織工程重點實驗室、上海市口腔醫(yī)學重點實驗室和上海市骨科內(nèi)植物重點實驗室。擁有上海市整復外科研究所、上海市口腔醫(yī)學研究所、上海市生物材料研究測試中心和上海交通大學醫(yī)學院眼科視覺研究所。上海市科技功臣1人，上海市十大科技精英2人。有中國工程院院士3人，973科學家1人，杰出青年3人，長江特聘/講座教授4人，新世紀百千萬工程人選3人、教育部跨世紀人才計劃4人、人社部突出貢獻中青年專家1人、衛(wèi)生部突出貢獻中青年專家4人、上海市領(lǐng)軍人才10人，以及上海市科委學科帶頭人、啟明星(后)、曙光計劃、醫(yī)學領(lǐng)軍人才等市級以上人才培養(yǎng)計劃100多人次。九院現(xiàn)為上海市住院醫(yī)師規(guī)范化培訓基地和專科醫(yī)師培訓基地。